Olex2中ReportPlus的应用 在撰写论文时,对于拥有多个晶体数据的你,可能会需要制作如下图所示的一个表格,该表格为某文献[1]支撑信息(Supporting Information)中的一个表格。 如果你手动进行制作这样一个表格,那么你需要在文献中寻找一个模板,上图表格第一列的信息,然后制作一个初表格,接着从CIF文件中将各个晶体的相关信息填写到对应的单元格中,或者你用shelxtl中的XCIF生成的单个晶体学报告中将每个晶体的相关信息手动整合到一起,这种方法可能比较耗费时间,尤其是第一种方法不仅耗时,而且可能会出差错。对于这种情况,Olex2中的ReportPlus给我们提供了一种高效的解决方法,关于扩展模块ReportPlus的安装,小伙伴们可以在以前的推文《Ole2中ReportPlus配置及添加引文》中查看,点击该标题即可查看该文章。 接下来我们来讲述一下如何用ReportPlus快速制作上述表格,首先我们从该文献所在期刊网下载其CIF文件,然后用Olex2打开该CIF文件,展示的是该CIF中第一个晶体数据,作者将该数据命名为1a,从当前数据编号可以看出该CIF中总共包含22个晶体数据,其中MultipleDataset下列出了所有数据,点击其中对应名称的按钮可以打开该数据: 其不对称单元显示在图形窗口(GraphicsWindow),如下图所示: Olex2中ReportPlus扩展模块安装好后,在Tools菜单栏下,首先我们展开ReportPlus一栏,接着再展开其中的Collections一栏,然后点击UseDataDir()/Collections folder按钮,如下图红色箭头所示: 点击Use DataDir()/Collections folder按钮后,Collections区域变成如下作图所示内容,我们在第一个方框中输入一个标题,例如我们要制作1a-1c三个数据的表格,我们就在其中输入1a-1c,在第二个方框中输入制作者名字,例如Tokyo,如下右图所示,这时这两个方框下面会出来两个可以点击的按钮,即"Add current structure (1a) to this collection"和"Add all from this CIF TABLE",如下图红色方框所示: 我们现在要制作的是1a-1c三个数据的表格,所以我们点击第一个按钮"Add current structure (1a) to this collection"将数据1a添加到这个集合中,这时该界面变成如下图所示模样,有一个橙色带下划线的1a按钮,以及IMG(可以添加晶体结构图),最后有一个红色的X,点击该X可以将该数据从该集合中删除: 这时我们回到Home菜单,点击1b按钮打开该数据,如下图所示: 然后回到ReportPlus中的Collections,点击"Add current structure (1b) to this collection"(下图红色箭头所示)将数据1b添加到这个集合中,这时该集合中有两个数据,橙色的1b表示当前打开的数据,点击位于其上方的绿色的1a则可以切换到1a数据,在红色的X后面有橙色的箭头(↑↓),可以对这个集合中的数据进行排序,如下图右所示: 重复上述步骤将1c数据添加到这个集合中。 期间有一点小问题,用从期刊网上下载的CIF集合无法生成报告,于是从该文章作者处拿到了单个cif文件,如下图所示: 按照之前讲述的方法制作一个包含这三个数据的集合(collection),然后点击"Makereport for current collection"按钮(下图红色按钮所示),接着等待报告生成: 生成报告后,数据所在文件夹则多出了如下所示的文件: 我们打开Tokyo.docx文档,其内容如下图所示: 其中各项参数名称该斜体的、该上下标的格式都已经自动设置好,标红的表示信息缺失,比如第二行的CCDC号,由于CIF中没有填写,所以该信息缺失。其中的内容大家可以根据自己需要进行删减。希望本篇内容对大家有所帮助。 视频版大家可以在我的B站(哔哩哔哩(bilibili))中观看:https://www.bilibili.com/video/av47063210 在B站中搜索关键词"DJ_Tokyo"查找用户可以找到我,往后有视频都将传至B站中,大家有兴趣的可以去B站观看。 参考文献: [1] Hong, D.; Zhu, X.; Wang, S.; Wei, Y.; Shou, S.; Huang, Z.; Zhu, S.; Wang,R.; Yue, W.; Mu, X. Synthesis, characterization, and reactivity of dinuclearorgano-rare-earth-metal alkyl complexes supported by 2-amidate-functionalized indolylligands: substituent effects on coordination and reactivity. Dalton Trans. 2019. DOI: 10.1039/c9dt00507b 如需PDF文档,请从以下链接下载: 通过网盘分享的文件:Olex2中ReportPlus的应用.pdf --来自百度网盘超级会员v1的分享
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