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数据还原时要不要积分fastscan图像 最近，单位某课题组同学的一个晶体数据，如图1所示（由Olex2[1]呈现）。
▲图1 数据状况 如图2所示为其还原后的数据文件，红色箭头为fastscan图像积分结果文件，即该数据包含了fastscan数据。 ▲图2 数据还原后的文件 该数据共有5轮衍射图像和1轮fastscan衍射图像，这个fastscan是测定警报所搜集的180幅衍射图像（曝光时间1秒），另外第1轮数据是数据收集策略中的fastscan（曝光时间1秒），第2‒5轮数据的曝光时间为10秒，其衍射图样如图3‒4所示（由APEX4[2]呈现），可以看出收据收集策略中的fastscan的衍射明显比测定晶胞的fastscan弱很多。
▲图3 衍射图样 ▲图4 衍射图样 图像积分情况如图5‒7所示，数据收集策略中的fastscan（第1轮数据）的平均相关系数ACC（Averagecorrelation coefficient）在0.35左右，而数据收集策略第2‒5轮数据的ACC在0.6左右，测定晶胞的fastscan的ACC则在0.5左右，显然第1轮数据（fastscan）最差。 ▲图5 图像积分情况 ▲图6 图像积分情况 ▲图7 图像积分情况 对于这种情况，笔者通常的做法是，在图像积分时，剔除fastscan衍射图像，即仅对第2‒5轮数据进行积分，如图8所示。 ▲图8 选择要积分的衍射图像 还原后当然只有第2‒5轮数据的文件，如图9所示。 ▲图9 重新还原后的文件 仅积分第2‒5轮数据结果如图10所示。
▲图10 仅积分第2‒5轮数据结果 对测定晶胞的fastscan单独计算晶胞进行单独积分，其ACC值亦接近0.6，如图11所示。 ▲图11 测定晶胞的fastscan单独计算晶胞进行单独积分情况 对第2‒5轮数据和测定晶胞的fastscan数据分别单独计算晶胞并单独积分，然后在Scale中合并数据后，结果如图12所示。
▲图12 第2‒5轮数据+测定晶胞的fastscan数据（分别计算晶胞和积分） 对第2‒5轮数据和测定晶胞的fastscan数据一起计算晶胞并进行积分，结果如图13所示。
▲图13 第2‒5轮数据+测定晶胞的fastscan数据（一起计算晶胞和积分） 上述不同积分结果的最终checkCIF报告如图14‒16所示。 ▲图14 所有数据一起积分最终结果的checkCIF ▲图15 仅积分第2‒5轮数据最终结果的checkCIF ▲图16 积分第2‒5轮数据+测定晶胞的fasctcan数据最终结果的checkCIF 数据质量对比 精修指标对比 CheckCIF报告对比（PLAT910、PLAT911和PLAT913警报报告的缺少衍射点的数量） 从上述结果来看，2‒5轮数+fastscan的结果最佳。 以下分享笔者的一点经验： 测试： 1、 如果仪器的测定晶胞被设定为180幅衍射图像，则测定晶胞时，如果时间充裕，可将曝光时间适当延长，笔者所在单位D8 Venture衍射仪默认步长下，1秒曝光时间测定晶胞约需3分钟，10秒曝光时间约需30分钟。 2、 程序计算的数据收集策略，前1轮或2轮（或更多）数据为fastscan（会有fastscan标识）的曝光时间默认为1秒，如果要保留这些fastscan，则最好将其曝光时间改为和其他轮数据的曝光时间一致（例如本案例中第2‒5轮数据的曝光时间为10秒，就可以将策略中的fastscan的曝光时间也设置为10秒），否则这个1秒曝光时间的fastscan数据可能没法用，甚至会拉低数据质量（如本案例数据），反倒是浪费机时（虽然只有3分钟）。 3、 如果测定晶胞时收集了完整的fastscan数据（180幅衍射图像），则可以删去数据收集策略中的fastscan。 4、如果测定晶胞时，未收集完整的180幅fastscan数据，例如收集20幅后直接停止，然后计算晶胞，计算数据收集策略，则可保留数据收集策略中的fastscan并将其曝光时间设置为和其他轮数据的曝光时间一致（或更长的曝光时间）。 数据还原： 1、 在APEX中，首先查看fastscan数据的曝光时间和其他轮数据的曝光时间是否一致，如果是默认的1秒曝光时间，并且衍射很弱（如本案例数据），则在积分时可以将fastscan数据剔除。 2、如果要积分fastscan数据，可以尝试分开单独积分和一起积分，哪个结果更好就采用哪个结果。 视频讲解请参阅： 数据还原时要不要积分fastscan图像：https://www.bilibili.com/video/BV143mkYpETX 参考文献 [1] Dolomanov, O. V.; Bourhis, L. J.; Gildea, R.J.; Howard, J. A. K.; Puschmann, H. OLEX2:A Complete Structure Solution, Refinement and Analysis Program. J. Appl. Cryst.2009, 42, 339–341. DOI:10.1107/S0021889808042726. [2] Bruker (2021). APEX4 (Version 2021.4-1).Program for Data Collection on Area Detectors. Bruker AXS Inc., Madison,Wisconsin, USA. 声明：本文仅代表个人观点，笔者学识有限，资料整理过程中可能存在疏漏错误，请不吝指正。 如需PDF文档，请从以下链接下载： 通过网盘分享的文件：数据还原时要不要积分fastscan图像.pdf --来自百度网盘超级会员v1的分享
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