无序示例-氮氧共占据无序(无序理解)

DJ_Tokyo

本文所用图形用户界面（GUI, GraphicalUser Interface）：Olex2[1]

本文所用结构精修程序：SHELXL[2]

本文案例来自Olex2程序（jaca_B07），获取途径如图1所示。

▲图1 本文案例数据获取途径

该结构不对称单元如图2所示，只有半个分子。

▲图2 不对称单元结构

中间噁唑环的氮和氧在不对称单元中占据同一位置，因此对其做了共占据无序，由于分子处于2次轴上，因此对称操作出来的原子相同，此时表观上看，两个组分的结构如图3所示。

▲图3 完整结构的两个无序组分

如果按照表观无序组分来绘制结构图，则会是如图4所示结果，这显然不对，PART 1变成阴离子，PART 2变成阳离子了（五元环是平面）。

▲图4 表观无序结构绘制结果

对于这种情况，就不能按照软件呈现来理解结构，否则和实际情况相差甚远，正确应理解并绘制成如图5所示结果。

▲图5 实际结构

视频演示操作请参阅：

Olex2无序Jaca结构B07解析(共占据无序-无序结构理解)：https://www.bilibili.com/video/BV1N142167R6

参考文献

[1]Dolomanov, O. V.; Bourhis, L. J.; Gildea, R. J.; Howard, J. A. K.; Puschmann,H. OLEX2: A complete structure solution,refinement and analysis program. J. Appl. Cryst. 2009, 42, 339–341.

[2](a) Sheldrick, G. M. SHELXL-2019/3, Program for Crystal Structure Refinement,University of Göttingen, Germany, 2019. (b) Sheldrick, G. M. A short history ofSHELX. Acta Cryst. 2008, A64, 112–122. (c) Sheldrick, G. M.Crystal structure refinement with SHELXL.Acta Cryst. 2015, C71, 3–8. (d)Lübben, J.; Wandtke, C. M.; Hübschle, C. B.; Ruf, M.; Sheldrick, G. M.;Dittrich, B. Aspherical scattering factors for SHELXL – model, implementation and application. Acta Cryst. 2019, A75, 50–62.

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