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[单晶结构] 如何用无序晶体结构发Nat. Chem.(无序代表的化学意义)

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发表于 2025-5-22 06:50:49 | 查看全部 |阅读模式
如何用无序晶体结构发Nat. Chem.(无序代表的化学意义)
案例来源:Nat.Chem. 2025, DOI[1]: 10.1038/s41557-025-01791-2.
论文中通过如1所示反应式合成Ce-1(由ChemBioDraw[2]绘制)。(注:Ce-1晶体结构中结晶了0.5个甲苯,所以其实际结构为Ce-1·0.5C7H8CCDC[3] 2355965),不过因为仅讨论主体结构,故而仅绘制主体结构,Ce-1·0.5C7H8的测试温度为100 K。)
1 Ce-1的合成
Ce-1在固态中温度高于263 K时会转变为Ce-2CCDC 2355968Ce-2·0.5C7H8的测试温度为283 K,接近室温),在溶液中则转变回Ce-1,如2所示。
2 Ce-1Ce-2之间的相互转化
作者在263 K温度下测试该晶体,收集99分钟的数据处理结果如3所示(由Olex2[4]呈现),Ce-1Ce-2两种结构的比例以第一无序组分C34CC35CC34AC35A的占有率来表示,分别为0.921(8)0.079(8),将该结果记为初始状态,99分钟的一半49.5作为第一个状态标记点,因此该结果代表第49.5分钟前后共计99分钟的平均结构。
3 49.5分钟的平均结构(CCDC 2357992
215.5分钟的平均结构如4所示,Ce-1Ce-2两种结构的比例变为0.880(9)0.120(9)
4 215.5分钟的平均结构(CCDC 2357993
以此类推,直到测到第20207.5分钟(14天)的平均结构如5所示,Ce-1Ce-2两种结构的比例变为0.230(9)0.770(9)
5 20207.5分钟的平均结构(CCDC 2358049
根据测试结果,绘制了如6所示Ce-1Ce-2结构比例变化趋势图,可以看出,在263 K温度下,晶体结构随着时间的推移,Ce-1逐渐减少(表现为无序组分原子C34CC35C占有率的下降),Ce-2逐渐增加(表现为无序组分原子C34AC35A占有率的上升)。
6 Ce-1Ce-2结构比例变化趋势图
两个无序组分单独显示如7所示。
7 无序组分单独显示结果
视频讲解请参阅:
如何用无序晶体结构发Nat.Chem.(无序代表的化学意义)https://www.bilibili.com/video/BV1yaJ6zHEoy
如需论文PDF文档和CIF[5]文件,请从以下链接下载:
提取码: mhsv
参考文献
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声明:本文仅代表个人观点,笔者学识有限,资料整理过程中可能存在疏漏错误,请不吝指正。
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