晶体数据审稿意见-分子量计算值和报告值存在差异

DJ_Tokyo

                              

晶体数据审稿意见-分子量计算值和报告值存在差异

最近，小红书上有有友友留言遇到如图1所示审稿意见。

▲图1 审稿意见

审稿意见	大意
The calculated and  reported molecular weights of the two compounds in the cif files show slight  discrepancies. Why ?	CIF[1]文件中计算和报告的两种化合物的分子量略有差异，为什么？

该审稿意见指的是CheckCIF[2]验证报告中分子量的计算值和报告值之间存在差异，笔者检查了一下笔者自己的晶体数据，发现很多晶体数据都存在这个差异，而且通常这个差异通常较小，如0.01或0.02等，笔者的其中一个数据如图2所示。

▲图2 案例

就该问题，笔者咨询了布鲁克公司的张老师，得到回复如图3所示，引发该差异的原因可能是因为不同的软件采用的摩尔原子质量不同，如精修程序SHELXL[3]可能采用的一套摩尔原子质量，而CheckCIF系统采取的是另一套摩尔原子质量。

▲图3 问题解答

视频讲解请参阅：

晶体数据审稿意见-分子量计算值和报告值存在差异：https://www.bilibili.com/video/BV1Mf421z74a

致谢

感谢张老师的耐心解答！

参考文献

[1] (a) Hall, S.  R.; Allen, F. H. Brown, I. D. The Crystallographic Information File (CIF): a  New Standard Archive File for Crystallography. Acta Cryst. 1991, A47, 655–685. DOI:  10.1107/S010876739101067X.  (b) Hall, S. R. The STAR File: A New Format for Electronic Data Transfer and  Archiving. J. Chem. Inf. Comput. Sci.  1991, 31, 326–333. DOI: 10.1021/ci00002a020. (c) Hall, S. R.; Spadaccini, N. The  STAR File: Detailed Specifications. J.  Chem. Inf. Comput. Sci. 1994, 34, 505–508. DOI:  10.1021/ci00019a005.    [2] (a)  Spek, A. L. Single-Crystal Structure Validation with the Program PLATON. J. Appl. Cryst. 2003, 36, 7–13. DOI: 10.1107/S0021889802022112. (b) Spek, A. L. Structure Validation in  Chemical Crystallography. Acta Cryst. 2009, D65, 148–155. DOI: 10.1107/S090744490804362X. (c) Spek, A. L. What Makes a Crystal Structure  Report Valid? Inorg. Chim. Acta 2018, 470, 232–237. DOI:  10.1016/j.ica.2017.04.036. (d)  Spek, A. L. checkCIF Validation  ALERTS: What They Mean and How to Respond. Acta Cryst. 2020, E76, 1–11. DOI: 10.1107/S2056989019016244.    [3] (a)  Sheldrick, G. M. SHELXL-2019/3, Program for Crystal Structure Refinement,  University of Göttingen, Germany, 2019. (b)  Sheldrick, G. M. A Short History of SHELX.  Acta Cryst. 2008, A64, 112–122. DOI: 10.1107/S0108767307043930. (c) Sheldrick, G. M. Crystal Structure  Refinement with SHELXL. Acta Cryst. 2015, C71, 3–8. DOI: 10.1107/S2053229614024218. (d) Lübben, J.; Wandtke, C. M.; Hübschle,  C. B.; Ruf, M.; Sheldrick, G. M.; Dittrich, B. Aspherical scattering factors  for SHELXL – model, implementation and  application. Acta Cryst. 2019, A75, 50–62. DOI:  10.1107/S2053273318013840.

声明：本文仅代表个人观点，笔者学识有限，资料整理过程中可能存在疏漏错误，请不吝指正。

如需PDF文档，请从以下链接下载：

通过网盘分享的文件：晶体数据审稿意见-分子量计算值和报告值存在差异.pdf

链接: https://pan.baidu.com/s/1uqR_OAp88Vas9RqCfveelg 提取码: zbka