CheckCIF-C级警报PLAT042处理案例

DJ_Tokyo

在精修中常会遇到C级警报PLAT042（参阅推文“CheckCIF-PLAT042”），以前是G级警报，最近似乎升级为C级了。PLAT042的IUCr释义如图1所示，引发此警报是因为残基分子式（MoietyFormula）的计算值和报告值不一致，残基分子式即CIF中“_chemical_formula_moiety”（参阅推文“CIF核心词典-chemical_formula”）的项目值。

                              

▲图1 IUCr官方PLAT042释义

排序引发PLAT042

解决方案：按照checkcif给出结果（即Calc结果）修改CIF中“_chemical_formula_moiety”条目即可，如下图所示

计数+括号引发PLAT042

解决方案：按照checkcif给出结果（即Calc结果）修改CIF中“_chemical_formula_moiety”条目即可，如下图所示

原子数目未省略引发PLAT042，如下图所示，溶剂二氯甲烷分子“C1 H2Cl2”中碳原子的数量为1，这个1可以省略，因此按照checkcif给出结果（即Calc结果）修改CIF中“_chemical_formula_moiety”条目即可

排序+计数引发PLAT042

解决方案：按照checkcif给出结果（即Calc结果）修改CIF中“_chemical_formula_moiety”条目即可

需要注意的是，当分子式中原子数量为1时，这个1没有省略的情况下会引发C级警报PLAT788，其IUCr官方释义如下图所示，当MoietyFormula的分子式中某元素的数字部分为1时应当删除。

其实引发这些警报，是因为SHELXL对于“_chemical_formula_moiety”条目中分子式的一些规则如排序、原子数量表达等待和checkcif网站不一致，可能随着SHELXL版本的更新，两者规则趋于相同时，就不会有这些警报了，说到底还是标准不同导致的。

两者标准没有对错，如果追求尽可能少的警报，那就按照checkcif的标准来即可。

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