申请CCDC号时慎重选择直接公开CIF

DJ_Tokyo

申请CCDC号时慎重选择直接公开CIF

最近，小红书上有小伙伴留言如图1‒2所示问题，自己的晶体数据CIF[1]文件在CCDC[2]申请CCDC号时直接选择了公开（参阅推文“申请CCDC号并直接发表CIF”），然后到了投文章的时候，期刊编辑告知不能作为新数据发表，只能引用，或者联系CCDC官方修改晶体数据状态（参阅推文“CCDC基操-申请CCDC误操作公开CIF挽回”）。

▲图1 问题描述

▲图2 问题描述

期刊编辑回信如下：

I am writing to you as the crystal structurewithin the manuscript has prior publication details and so we would not be ableto present it as new but would have to add reference for their CSDpublication·(********* ICSD Communication,2024 Deposited Date: 15 October 2024).

If on deposition with CSD you selected theoption to "Publish in a database" in error during the depositionprocess, you may be able to kindly request CCDC that the structure with depositionnumbers ******* not be published in this way, and if they could update the dataaccordingly. Please can you contact CCDC and request this if that is how youwould like to proceed ?

If you wish to leave as is, we will need toremove the crystal footnote and add reference to the CSD Communications for the crystal structure (and send me therevised manuscript file).

我写信给您，因为手稿中的晶体结构有之前的出版细节，所以我们无法将其作为新的晶体结构，但必须为他们的CSD出版物添加参考文献（********《ICSD通讯》，2024保存日期：2024年10月15日）。

如果在CSD进行存储时，您在存储过程中错误地选择了“在数据库中发表”选项，您可以请求CCDC不要以这种方式发表存储编号为******的结构，并且他们是否可以相应地更新数据。如果您想这样做，请联系CCDC并提出请求？

如果您想按原样保留，我们需要删除晶体脚注，并添加晶体结构的《CSD通讯》引用（并将修订后的手稿文件发给我）。

我们假设自己合成的晶体结构申请的CCDC号为2389696，并且该结构在申请CCDC号时已经发表在《CSD通讯》，在该数据详情页面的Publication处可以看到其出版信息，包括作者、出版物和日期等，如图3所示。

▲图3 CCDC 2389696详情页

那么在写论文的时候，比如第一次提到该晶体结构时，要引用第10篇参考文献了，则在参考文献列表中按如下格式引用即可（亦可将CSDCommunication缩写为CSD Commun.）：

9. ·············

10. Hong, D. CSD Communication 2024, Deposited Date: 9 October 2024.

11. ·············

上述案例中，虽然晶体数据是自己的，并且是准备要在即将发表的文章中进行发表，但由于申请CCDC号时有意或无意使得CIF在申请时直接公开，从而导致在即将发表的文章中也只能进行引用，而不能作为新的晶体数据发表。所以在申请CCDC号时，对于是否要选择直接公开，最好是慎重考虑。（注：CCDC号在文章投稿前一周左右时间申请即可，没必要拿到晶体数据就立即申请。）

该小伙伴发现次日CCDC官方给了回信，并且把晶体数据状态由Published改回了Unpublished，如图4所示。

▲图4 晶体数据状态修改成功反馈

视频讲解请参阅：

申请CCDC号时慎重选择直接公开CIF：https://www.bilibili.com/video/BV1Fu1HYjEtQ

参考文献

[1]    (a) Hall, S. R.; Allen, F. H. Brown, I. D.The Crystallographic Information File (CIF): a New Standard Archive File forCrystallography. Acta Cryst. 1991, A47, 655–685. DOI:10.1107/S010876739101067X. (b) Hall, S. R. The STAR File: A New Formatfor Electronic Data Transfer and Archiving. J.Chem. Inf. Comput. Sci. 1991, 31, 326–333. DOI:10.1021/ci00002a020. (c) Hall, S. R.; Spadaccini, N. The STAR File:Detailed Specifications. J. Chem. Inf.Comput. Sci. 1994, 34, 505–508. DOI:10.1021/ci00019a005.

[2]    (a) Allen, F. H. The Cambridge StructuralDatabase: a quarter of a million crystal structures and rising. Acta Cryst. 2002, B58, 380–388. DOI: 10.1107/S0108768102003890. (b) Groom, C. R.;Bruno, I. J.; Lightfoot, M. P.; Ward, S. C. The Cambridge Structural Database. Acta Cryst. 2016, B72, 171–179. DOI: 10.1107/S2052520616003954. (c) Mitchell, J.;Robertson, J. H.; Raithby, P. R. Cambridge Crystallographic Data Centre (CCDC).Comprehensive Coordination Chemistry III2021, 413–437. DOI: 10.1016/B978-0-12-409547-2.14829-2.

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