Olex2溶剂遮掩如何填写多种不同溶剂

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Olex2溶剂遮掩如何填写多种不同溶剂

之前，B站有小伙伴提到如图1所示问题，即溶剂遮掩后如何填写多种不同溶剂。

▲图1 问题描述

接下来以论文“J. Coord. Chem. 2024, 77, 310‒345. DOI[1]: 10.1080/00958972.2024.2311715.”中CCDC[2] 2259290结构为例来说明这个问题。

其实很简单，不同的溶剂用逗号隔开，依次填写即可，如图2所示，该结构用Olex2[3]的Solvent Mask[4]例程做了溶剂遮掩，遮掩的电子数是20个，溶剂种类则有甲醇和水，甲醇的数量为0.5个，水的数量为1个，因此在Content/Asymmetric Unit下点击Edit弹出的窗口中填入“0.5 CH4O, 1 H2O”（或者“0.5 CH3OH, 1 H2O”或者“1 H2O, 0.5 CH4O”）即可，不同溶剂种类之间用逗号隔开，溶剂数量和溶剂之间用空格隔开，逗号之后添加一个空格，如图3所示。

▲图2 溶剂遮掩结果页面

▲图3 Edit Mask content for VoidNo 1|1 based on Asymmetric unit

按照之前推文“Olex2中如何把溶剂遮掩内容添加到总分子式中(审稿意见)”方法把溶剂遮掩的内容添加到总分子式中，其CIF[5]中分子式如图4所示。

▲图4 CIF中的分子式

在之前的推文“晶体(CIF)结构与实际结构之间的差别”中我们讲过，实际结构 = 晶体(CIF)结构 + 未建模的结构 = 晶体(CIF)结构 + 遮掩的结构，因此，如果元素分析样品和测晶体的样品是同一批，则两者数据应当对应，本文中显然属于此列，所以元素分析的理论值基于CIF中总分子式“C41H32N8O15Zn2”计算，如图5所示。（当然，如果元素分析的样品和测晶体的样品不是同一批，则不需要对应，参阅推文“元素分析与晶体结构之间的关系(审稿意见)”。）

▲图5 元素分析所用分子式

视频讲解请参阅：

Olex2溶剂遮掩如何填写多种不同溶剂：https://www.bilibili.com/video/BV1rXNme6Ezj

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链接:https://pan.baidu.com/s/186b7AtHp6OYhC0BD7lqxdQ

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参考文献

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