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[单晶结构] 晶体测试案例38(弱衍射晶体)

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发表于 2025-5-2 09:37:02 | 查看全部 |阅读模式

晶体测试案例38(弱衍射晶体)
最近,同单位某课题组同学委托笔者帮忙测试晶体,该晶体在20毫升玻璃样品瓶中培养,溶剂已挥发干,瓶底观察视角如1所示,基本上是针状晶体。
1 瓶底视角晶体
当时瞄了一眼,我说这个应该测不了,但对方表示侧壁有较大的晶体,如2所示。
2 侧壁上的较大晶体
在显微镜下观察,如3所示。
3 显微镜下观察侧壁上的较大晶体
用刮勺将其从瓶中抠出来,放在载玻片上用二甲基硅油(CAS: 9006-65-9)覆盖,晶体并不均一,如4左侧,简单捣碎后有片状和针状,考虑到片状太薄难以安装,于是选用了针状,如4右侧红色箭头所指。
4 晶体的切割与选取
用真空硅脂(7501高真空硅脂)将该针状晶体粘在玻璃丝侧边,顶端突出,如5所示。
5 安装好的晶体
为减少玻璃丝在衍射中的影响,晶体对心时尽量时玻璃丝远离中心,同时测量一下晶体尺寸(参阅推文“布鲁克D8 VENTURE测量晶体尺寸操作步骤”或视频“APEX3 D8 Venture对心时晶体尺寸的测量:https://www.bilibili.com/video/BV1Cq4y1d7S5”和“晶体尺寸的测量:https://www.bilibili.com/video/BV1hM4y1J71o”),大约为0.1207 × 0.1323× 0.6780 mm3(晶体长度明显长于0.6780 mm,因为剩余部分在屏幕外,未测到),如6‒8所示(由APEX3[1]呈现),最大尺寸大于其他两个任意尺寸的2倍以上,是典型的针状(needle)晶体参阅视频“晶体尺寸和晶癖描述需保持一致:https://www.bilibili.com/video/BV1yb421B72r”。
6 晶体尺寸测量
7 晶体尺寸测量
8 晶体尺寸测量
在晶体对心时,可顺便拍摄晶体照片(参阅推文“D8 Venture衍射仪拍摄晶体照片”)保存,可作为论文插图,如9所示。
9 仪器拍摄的晶体照片
先上机用钼靶尝试了一下,发现衍射非常弱(1秒曝光时间),遂果断换用铜靶进行测试,按照10秒曝光时间测试,虽然分辨率不高,但还是有明显信号的,如10所示(由APEX4[2]呈现)。
10 衍射图
测定晶胞可知,最大晶轴不超过13Å,探测器与晶体之间的距离采用程序给定的39.00 mmBravaisLatticeMonoclinicP,故而对称性选择2/m,分辨率设定为0.83 Å,计算得到的数据收集策略共10轮数据,其中前2轮为fastscan,步长为2.00°,曝光时间为10.0秒,预计总时长1小时43分钟,如11所示。
11 初始数据收集策略
因为测试机时是整小时预约的,保留第1fastscan并将其曝光时间改为10秒,删去第2轮衰减的fastscan,发现结束时间大于为11:30,于是将曝光时间增大为14秒,结束时间在12点左右,如12所示。
12 调整后的数据收集策略
最终处理结果如13所示(由Olex2[3]呈现),无AB级警报。
13 数据结果
参考文献
[1]    Bruker (2018). APEX3 (Version 2018.7-2). Program for Data Collection on AreaDetectors. Bruker AXS Inc., Madison, Wisconsin, USA.
[2]    Bruker (2021). APEX4 (Version 2021.4-1). Program for Data Collection on AreaDetectors. Bruker AXS Inc., Madison, Wisconsin, USA.
[3]    Dolomanov, O. V.;Bourhis, L. J.; Gildea, R. J.; Howard, J. A. K.; Puschmann, H. OLEX2: A Complete Structure Solution,Refinement and Analysis Program. J. Appl. Cryst. 2009, 42, 339–341. DOI: 10.1107/S0021889808042726.
声明:本文仅代表个人观点,笔者学识有限,资料整理过程中可能存在疏漏错误,请不吝指正。
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