晶体测试案例38(弱衍射晶体) 最近,同单位某课题组同学委托笔者帮忙测试晶体,该晶体在20毫升玻璃样品瓶中培养,溶剂已挥发干,瓶底观察视角如图1所示,基本上是针状晶体。 ▲图1 瓶底视角晶体 当时瞄了一眼,我说这个应该测不了,但对方表示侧壁有较大的晶体,如图2所示。 ▲图2 侧壁上的较大晶体 在显微镜下观察,如图3所示。 ▲图3 显微镜下观察侧壁上的较大晶体 用刮勺将其从瓶中抠出来,放在载玻片上用二甲基硅油(CAS: 9006-65-9)覆盖,晶体并不均一,如图4左侧,简单捣碎后有片状和针状,考虑到片状太薄难以安装,于是选用了针状,如图4右侧红色箭头所指。 ▲图4 晶体的切割与选取 用真空硅脂(7501高真空硅脂)将该针状晶体粘在玻璃丝侧边,顶端突出,如图5所示。 ▲图5 安装好的晶体 为减少玻璃丝在衍射中的影响,晶体对心时尽量时玻璃丝远离中心,同时测量一下晶体尺寸(参阅推文“布鲁克D8 VENTURE测量晶体尺寸操作步骤”或视频“APEX3 D8 Venture对心时晶体尺寸的测量:https://www.bilibili.com/video/BV1Cq4y1d7S5”和“晶体尺寸的测量:https://www.bilibili.com/video/BV1hM4y1J71o”),大约为0.1207 × 0.1323× 0.6780 mm3(晶体长度明显长于0.6780 mm,因为剩余部分在屏幕外,未测到),如图6‒8所示(由APEX3[1]呈现),最大尺寸大于其他两个任意尺寸的2倍以上,是典型的针状(needle)晶体,参阅视频“晶体尺寸和晶癖描述需保持一致:https://www.bilibili.com/video/BV1yb421B72r”。 ▲图6 晶体尺寸测量 ▲图7 晶体尺寸测量 ▲图8 晶体尺寸测量 ▲图9 仪器拍摄的晶体照片 先上机用钼靶尝试了一下,发现衍射非常弱(1秒曝光时间),遂果断换用铜靶进行测试,按照10秒曝光时间测试,虽然分辨率不高,但还是有明显信号的,如图10所示(由APEX4[2]呈现)。 ▲图10 衍射图 测定晶胞可知,最大晶轴不超过13Å,探测器与晶体之间的距离采用程序给定的39.00 mm,BravaisLattice为MonoclinicP,故而对称性选择2/m,分辨率设定为0.83 Å,计算得到的数据收集策略共10轮数据,其中前2轮为fastscan,步长为2.00°,曝光时间为10.0秒,预计总时长1小时43分钟,如图11所示。 ▲图11 初始数据收集策略 因为测试机时是整小时预约的,保留第1轮fastscan并将其曝光时间改为10秒,删去第2轮衰减的fastscan,发现结束时间大于为11:30,于是将曝光时间增大为14秒,结束时间在12点左右,如图12所示。 ▲图12 调整后的数据收集策略 最终处理结果如图13所示(由Olex2[3]呈现),无AB级警报。 ▲图13 数据结果 参考文献 [1] Bruker (2018). APEX3 (Version 2018.7-2). Program for Data Collection on AreaDetectors. Bruker AXS Inc., Madison, Wisconsin, USA. [2] Bruker (2021). APEX4 (Version 2021.4-1). Program for Data Collection on AreaDetectors. Bruker AXS Inc., Madison, Wisconsin, USA. [3] Dolomanov, O. V.;Bourhis, L. J.; Gildea, R. J.; Howard, J. A. K.; Puschmann, H. OLEX2: A Complete Structure Solution,Refinement and Analysis Program. J. Appl. Cryst. 2009, 42, 339–341. DOI: 10.1107/S0021889808042726. 声明:本文仅代表个人观点,笔者学识有限,资料整理过程中可能存在疏漏错误,请不吝指正。 如需PDF文档,请从以下链接下载: 通过网盘分享的文件:晶体测试案例38(弱衍射晶体).pdf
|